La vegetación en el Parque es diversa, en las zonas más altas se desarrolla una vegetación de tipo selva mediana, mientras que en las partes bajas se desarrollan ecosistemas de humedal a manera de parches entre la vegetación de selva o bien en las secciones cercanas a la costa. En dichos humedales habitan las especies de mangle botoncillo (Conocarpus erectus), blanco (Laguncularia racemosa), negro (Avicennia germinans) y rojo (Rhizophora mangle).